参考答案: D

详细解析:

本题考查协议的内容
关键词：项目经理和供应商关于项目的具体功能是否在合同中出现分析，首先应该做的是查看协议中的内容，确定是否包含，选项D正确。
选项A，提交变更请求是在确定没有包含在合同中，并且要添加新的需求时使用的。
选项B，协商处理问题是当成了纠纷，与供应商之间出现纠纷，首先协商，协商无果回去调解，调解也没有解决，后续可能需要仲裁走法律程序。但是现在并没有出现纠纷，只是双方不知道是否包含，所以先看协议里面的内容，再到后续步骤。
选项C，当前的供应商并没有侵权等问题，不能直接就取消合作，需要看合同中的内容。
所属领域：过程