参考答案:

【问题1】
（1）不合法。依据《中华人民共和国招投标法》：任何单位和个人不得违法限制或者排斥本地区、本系统以外的法人或者其他组织参加投标，不得以任 何方式非法干涉招标投标活动。
《国家电子政务项目建设暂行管理办法》：项目建设单位应建立健全责任制，并严格执行招标投标、政府采购、工程监理、合同管理等制度。
（2）无效。联合体的资质等级是依据联合体中资质较低的单位等级来确定联合体的资质。A是二级，C是三级，则联合资质是三级。
【问题2】
B单位的投标文件有效；
D投标人的投标文件（或原投标文件）有效。但补充说明无效，因开标后投标人不能变更（或更改）投标文件的实质性内容。
E投标人的投标文件有效。
F投标人的投标文件有效。
【问题3】
评标委员会中技术、经济专家占总人员的七分之四，少于三分之二。理由：依据《中华人民共同国招投标法》第三十七条：评标由招标人依法组建的评标委员会负责。
依法必须进行招标的项目，其评标委员会由招标人的代表和有关技术、经济等方面的专家组成，成员人数为五人以上单数，其中技术、经济等方面的专家不得少于成员总数的三分之二。

详细解析:

【问题1】
（1）不合法。依据《中华人民共和国招投标法》：任何单位和个人不得违法限制或者排斥本地区、本系统以外的法人或者其他组织参加投标，不得以任何方式非法干涉招标投标活动。
《国家电子政务项目建设暂行管理办法》：项目建设单位应建立健全责任制，并严格执行招标投标、政府采购、工程监理、合同管理等制度。
（2）无效。联合体的资质等级是依据联合体中资质较低的单位等级来确定联合体的资质。A是二级，C是三级，则联合资质是三级。
【问题2】
B单位的投标文件有效；
D投标人的投标文件（或原投标文件）有效。但补充说明无效，因开标后投标人不能变更（或更改）投标文件的实质性内容。
E投标人的投标文件有效。
F投标人的投标文件有效。
【问题3】
评标委员会中技术、经济专家占总人员的七分之四，少于三分之二。理由：依据《中华人民共同国招投标法》第三十七条：评标由招标人依法组建的评标委员会负责。
依法必须进行招标的项目，其评标委员会由招标人的代表和有关技术、经济等方面的专家组成，成员 人数为五人以上单数，其中技术、经济等方面的专家不得少于成员总数的三分之二。