参考答案: D

详细解析:

本题考查“契税计税依据”知识点。《中华人民共和国契税暂行条例》第四条规定，国有土地使用权出让、土地使用权出售、房屋买卖，以成交价格作为计税依据。成交价格是指土地、房屋权属转移合同确定的价格，包括承受者应交付的货币、实物、无形资产或其他经济利益。本题中，成交价格包括土地使用权价款2000万元和厂房及地上附着物价款500万元，甲公司应缴纳的契税＝（2000＋500）×3%＝75（万元）。故正确答案为D。