参考答案: C

详细解析:

选项A，合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额不得高于工程款结算总额的3%；选项B，社会投资项目采用预留保证金方式的，发、承包双方可以将保证金交由第三方金融机构托管；选项D，在工程项目竣工前，已经缴纳履约保证金的，发包人不得同时预留工程质量保证金。故本题选C。